Матеріально-технічна база
- Лабораторія міжнародного науково-технічного співробітництва та інтелектуальної власності
- Наукова бібліотека
- Лабораторія екологічних досліджень
- Лабораторія гідробіології та технологій культивування цінних безхребетних
- Лабораторія кормів і годівлі риб
- Лабораторія лососівництва
- Сектор осетрівництва
- Відділ іхтіопатології
- Відділ вивчення біоресурсів водосховищ
- Флот (є у підпорядкуванні відділу вивчення біоресурсів водосховищ)
- Відділ селекції риб
- Відділ молекулярно-генетичних досліджень
- Лабораторія біотехнологій в рибництві
- Відділ економіки та планування наукових досліджень